Nobuaki Kono
河野 暢明 コウノ ノブアキ

政策・メディア研究科特任講師
学位博士(学術)
略歴2008年 慶應義塾大学 環境情報学部卒
2010年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科修士課程修了
2010年 日本学術振興会特別研究員(DC1)
2012年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科博士課程修了
2012年 日本学術振興会特別研究員(PD)
2013年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科 研究員
2014年 大阪大学大学院 医学系研究科 特任助教
2015年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科 特任助教
2018年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科 特任講師
専門分野生命情報科学、合成生物学、ゲノム科学
所属学会・団体International Society for Computational Biology (ISCB)
日本分子生物学会
日本バイオインフォマティクス学会
日本ゲノム微生物学会
日本蜘蛛学会
日本ゲノム微生物学会若手の会
生命情報科学若手の会
主要著作・論文・作品Kono N, Nakamura H, Ohtoshi R, Moran DAP, Shinohara A, Yoshida Y, Fujiwara M, Mori M, Tomita M, Arakawa K. (2019) Orb-weaving spider Araneus ventricosus genome elucidates the spidroin gene catalogue, Sci Rep., 9(1):8380.

Kono N, Nakamura H, Ohtoshi R, Tomita M, Numata K, Arakawa K (2019) The bagworm genome reveals a unique fibroin gene that provides high tensile strength, Communications Biology, 2:148.

Kono N, Arakawa K. (2019) Nanopore sequencing: Review of potential applications in functional genomics, Dev Growth Differ., [Epub ahead of print].

Ohshima Y, Kono N*, Yokota Y, Watanabe S, Sasaki I, Ishioka N, Sakashita T, Arakawa K (2019) Anti-tumor Effects and Potential Therapeutic Response Biomarkers in α-Emitting meta-211At-Astato-Benzylguanidine Therapy for Malignant Pheochromocytoma Explored by RNA-sequencing, Theranostics, 9(6):1538-1549.

Kono N*, Tomita M, Arakawa K (2018) Accelerated laboratory evolution reveals the influence of replication on the GC skew in Escherichia coli. Genome Biology and Evolution 10(11):3110-3117.

Kono N*, Tomita M, Arakawa K (2017) eRP arrangement: a strategy for assembled genomic contig rearrangement based on replication profiling in bacteria. BMC Genomics 18(1):784.

Kono N, Nakamura H, Ito Y, Tomita M, Arakawa K (2016) Evaluation of the impact of RNA preservation methods of spiders for de novo transcriptome assembly. Molecular Ecology Resources 16(3):662-672.

Kono N*, Arakawa K, Sato M, Yoshikawa H, Tomita M, Itaya M (2014) Undesigned selection for replication termination of bacterial chromosomes. Journal of Molecular Biology 426(16), 2918-2927.

Kono N, Arakawa K, Tomita M (2012) Validation of Bacterial Replication Termination Models Using Simulation of Genomic Mutations. PLoS One 7(4), e34526.

Kono N, Arakawa K, Tomita M (2011) Comprehensive prediction of chromosome dimer resolution sites in bacterial genomes. BMC Genomics 12(1), 19.

Kono N, Arakawa K, Ogawa R, Kido N, Oshita K, Ikegami K, Tamaki S, Tomita M (2009) Pathway Projector: Web-Based Zoomable Pathway Browser Using KEGG Atlas and Google Maps API. PLoS One 4(11), e7710.

Kono N, Arakawa K, Tomita M (2006) MEGU: Pathway mapping web-service based on KEGG and SVG. In Silico Biology 6(6), 621-655.

Ii MK, Kono N, Paulino-Lima IG, Tomita M, Rothschild LJ, Arakawa K (2019) Complete genome sequence of Arthrobacter sp. Strain MN05-02, a UV-resistant bacterium from a manganese deposit in the Sonoran Desert, Journal of Genomics, 7:18-25.

Arakawa K, Kono N, Ohtoshi R, Nakamura H, Tomita M (2018) The complete mitochondrial genome of Eumeta variegata (Lepidoptera: Psychidae), Mitochondrial DNA Part B 3(2):812-813.

Itaya M, Sato M, Hasegawa M, Kono N, Tomita M, Kaneko S (2018) Far rapid synthesis of giant DNA in the Bacillus subtilis genome by a conjugation transfer system. Scientific Reports, 8(1):8792.

Kanoh Y, Matsumoto S, Fukatsu R, Kakusho N, Kono N, Renard-Guillet C, Masuda K, Iida K, Nagasawa K, Shirahige K, Masai H (2015) Rif1 binds to G quadruplexes and suppresses replication over long distances. Nature Structural & Molecular Biology 22(11), 889-897.

Hisano Y, Ota S, Arakawa K, Muraki M, Kono N, Oshita K, Sakuma T, Tomita M, Yamamoto T, Okada Y, Kawahara A (2013) Quantitative assay for TALEN activity at endogenous genomic loci. Biology Open BIO20133871.

Toya Y, Kono N, Arakawa K, Tomita M (2011) Metabolic flux analysis and visualization. Journal of Proteome Ressearch 10(8), 3313-3323.

Arakawa K, Tamaki S, Kono N, Kido N, Ikegami K, Ogawa R, Tomita M, (2009) Genome Projector: zoomable genome map with multiple views. BMC Bioinformatics 10(1), 31.

Tamaki S, Arakawa K, Kono N, Tomita M (2007) Restauro-G: A Rapid Genome Re-Annotation System for Comparative Genomics. Genomics Proteomics Bioinformatics 5(1), 53-58.

Arakawa K, Kono N, Yamada Y, Mori H, Tomita M (2005) KEGG-based pathway visualization tool for complex omics data. In Silico Biology 5, 0039.
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